A erliquiose monocítica canina (EMC) é uma doença infecciosa causada pela bactéria Ehrlichia canis, com sinais clinicos relacionados a aplasia de medula óssea e trombocitopenia. As lesões de necropsia são inespecíficas, podendo ocorrer hemorragias disseminadas, esplenomegalia, hepatomegalia e linfoadenomegalia. Microscopicamente, os achados dependem da fase clínica da doença, mas, frequentemente, ocorrem hemorragias multifocais, infiltrado linfoplasmocitário perivascular e vasculite em vários tecidos, baço com hiperplasia da polpa branca, pneumonia intersticial, glomerulonefrite membranosa e aplasia de medula óssea. O diagnóstico baseia-se nas manifestações clínicas, nas lesões de necropsia e no achado de inclusões riquetsiais em citoplasma de monócitos e linfócitos, as quais são raras e visualizadas somente na fase aguda da doença. Desta forma, o objetivo deste estudo foi descrever as principais lesões observadas na EMC, validar uma PCR em tecidos para o diagnóstico molecular da erliquiose canina e identificar a cepa de E. canis circulante em cães no Sul de Minas Gerais. Tecidos de quarenta caninos encaminhados para necropsia no Setor de Patologia Veterinária da UFLA foram submetidos a histopatologia e Nested-PCR. Destes, 28 apresentaram lesões compatíveis e PCR positivo para EMC e 12 animais diagnosticados com outras doenças foram negativos na PCR para EMC (controle negativo). Na PCR realizada em amostras de baço e rim, 14 cães (50%) foram positivos em ambos os órgãos, 16 (57,1%) positivos no baço e 26 caninos (92,8%) positivos no rim. As lesões macroscópicas mais frequentes na EMC foram edemas e hemorragias generalizadas, anemia e icterícia, lesões de insuficiência renal crônica (uremia), linfadenomegalia, esplenomegalia e hepatomegalia. Microscopicamente hemorragias e trombose multifocal, hemossiderose acentuada em baço, linfonodo e medula óssea, aplasia de medula óssea, nefrite intersticial linfoplasmocitária, glomerulonefrite membranosa e congestão acentuada com atrofia de cordões de hepatócitos foram os achados mais importantes. Necrose fibrinoide de paredes vasculares e vasculite foram observadas em cinco animais (17,8%). A sequência obtida de E. canis, quando comparada com as sequências dos fragmentos dos genes disponíveis no GenkBank, obtiveram 95,9% de identidade com a cepa E. canis Jake (NC_007354.1) e 95,6% com a cepa Oklahoma (NR_118741.1). A nested-PCR associada às lesões se mostrou efetiva para o diagnóstico da EMC.