Dados do Trabalhos de Conclusão

UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO
BIOLOGIA ESTRUTURAL E FUNCIONAL (33009015034P6)
ANÁLISE DA EXPRESSÃO E DO NÚMERO DE CÓPIAS GÊNICAS DE microRNA DA REGIÃO 8q24.21 NO CÂNCER GÁSTRICO
ANA CAROLINA ANAUATE PEREIRA
DISSERTAÇÃO
24/05/2018

Analisar a expressão de miR-1204, miR-1205, miR-1206, miR-1207 e miR-1208 em tecido gástrico neoplásico e não neoplásico de pacientes com e sem CG, determinar os genes de referência para essa análise, avaliar o número de cópias gênicas desses miRNA, e associar estas variáveis com os parâmetros clínicos e patológicos dos pacientes com CG. Métodos: A expressão dos miRNA alvos miR-1204, miR-1205, miR-1206, miR-1207-5p, miR-1207-3p, e miR-1208 foi avaliada por RT-qPCR em 65 pares de amostras neoplásicas (T) e margem adjacente não neoplásicas (A) de pacientes com CG, e 20 amostras de tecido gástrico não neoplásica de indivíduos sem câncer submetidos à endoscopia (C), e determinada pelo método ΔCt. O número de cópias dos genes miR-1204, miR-1205, miR-1207, e miR-1208 foi determinado por qPCR em 69 amostras T e com o uso do programa Copy Caller. Resultados: O grupo de amostras C não diferiu em relação ao gênero e idade dos pacientes com CG (p>0,05). Apenas o miR-1205 apresentou diferença de expressão entre os grupos de amostra A e C, com maior expressão no grupo A (p=0,02). Não foi observada expressão de miR-1204 e miR-1206 nas amostras de tecido gástrico analisadas. Foi observada uma correlação positiva e forte entre a expressão de miR-1207-5p e miR-1208 (p<0,01, ρ=0,71), e uma correlação positiva, mas fraca, entre a expressão de miR-1205 e miR-1207-3p (p=0,04, ρ=0,21). Não foi observada associação entre a expressão de miR-1205, miR-1207-5p, miR-1207-3p, e miR-1208 e o número de cópias dos seus respectivos genes (p>0,05). O aumento do número de cópias do gene miR-1207 foi associado aos tumores localizados na região não cárdia do estômago (p=0,01), e a perda do número de cópias do gene miR-1208 à presença de infecção por H. pylori (p=0,01). Conclusões: Não foram encontradas diferenças significantes entre a expressão de miR-1205, miR-1207-5p, miR-1207-3p, e miR-1208 nas amostras T vs A, e entre T vs C. Porém, o miR-1205 apresentou expressão aumentada nas amostras A em relação às C. Os resultados sugerem que o miR-1205 parece ter um papel importante no início do desenvolvimento do CG. Além disso, a ausência de associação entre a expressão desses miRNA e o número de cópias gênicas indica que a alteração do número de cópias do miR-1205 não seja o mecanismo que leva à sua desregulação nas amostras avaliadas.

1. Câncer gástrico. 2. microRNA. 3. Expressão gênica.
To analyze the expression of miR-1204, miR-1205, miR-1206, miR-1207 and miR-1208 in neoplastic and non-neoplastic gastric tissue from patients with and without GC, determine the reference genes for this analysis, the number of gene copies of these miRNAs, and to associate these variables with the clinical and pathological parameters of GC patients. Methods: The expression of miR-1204, miR-1205, miR-1206, miR-1207-5p, miR-1207-3p, and miR-1208 target miRNA was evaluated by RT-qPCR in 65 paired neoplastic (T) and adjacent non-neoplastic (A) samples from patients with GC, and 20 non-neoplastic gastric tissue samples from cancer-free individuals submitted to endoscopy (C), and determined by the ΔCt method. The number of copies of the miR-1204, miR-1205, miR-1207, and miR-1208 genes was determined by qPCR in 69 T samples using the Copy Caller program. Results: The C group of samples did not differ in relation to gender and age of CG patients (p> 0.05). Only miR-1205 presented different expression between A and C groups, with higher expression in A group (p = 0.02). Expression of miR-1204 and miR-1206 was not observed in the analyzed gastric tissue samples. A strong positive correlation was observed between miR-1207-5p and miR-1208 expression (p <0.01, ρ = 0.71), and a very weak positive correlation between miR-1205 and miR-1207-3p expression (p = 0.04, ρ = 0.21). No association was observed between miR-1205, miR-1207-5p, miR-1207-3p, and miR-1208 expression and the number of copies of their respective genes (p> 0.05). Increased miR-1207 gene copy number was associated with tumors located in non-cardiac region of the stomach (p = 0.01), and the loss of copies of miR-1208 gene was associated with H. pylori infection (p = 0.01). Conclusion: No significant differences were found between miR-1205, miR-1207-5p, miR-1207-3p, and miR-1208 expression in T vs A and T vs C samples. However, miR-1205 showed an increased expression in A samples compared to C samples. The results suggest that miR-1205 participates in the beginning of GC development. In addition, the absence of association between these miRNA expressions and the gene copy number indicates that the change in miR-1205 copy number is not the mechanism leading to its deregulation in the samples tested.
1. Gastric cancer. 2. microRNA. 3. Gene expression.
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PORTUGUES
UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO PAULO
O trabalho não possui divulgação autorizada

Contexto

GENÉTICA
GENÉTICA E EPIGENÉTICA DO CÂNCER
Aspectos genéticos e epigenéticos da carcinogênese gástrica

Banca Examinadora

MARILIA DE ARRUDA CARDOSO SMITH
DOCENTE - PERMANENTE
Sim
Nome Categoria
TAIZA STUMPP TEIXEIRA Docente - PERMANENTE
VANESSA KIYOMI OTA KUNIYOSHI Participante Externo
ROGER CHAMMAS Participante Externo

Financiadores

Financiador - Programa Fomento Número de Meses
FUND COORD DE APERFEICOAMENTO DE PESSOAL DE NIVEL SUP - Programa de Demanda Social 20

Vínculo

Colaborador
Instituição de Ensino e Pesquisa
Ensino e Pesquisa
Sim