Dados do Trabalhos de Conclusão

UNIVERSIDADE FEDERAL DA BAHIA
Zootecnia (28001010088P7)
Avaliação genético-quantitativa e genômica de características reprodutivas em bovinos da raça Nelore
CAIO VICTOR DAMASCENO CARVALHO
TESE
18/08/2017

Capítulo 1: O presente estudo teve objetivo avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente (IGA) para as características perímetro escrotal mensurado em diferentes idades, 365 (PE365), 450 (PE450) e 550 (PE550) dias de idade, e da idade ao primeiro parto (IPP) para animais da raça Nelore criados em diferentes regiões do Brasil. Para a avaliação foram agrupados os rebanhos nas seguintes regiões do país: Norte, Sudeste e Centro- Oeste, sendo utilizados informações de 26619, 28730, 14476, 15397 para as características PE365, PE450, PE550 e IPP respectivamente. Os parâmetros genéticos, assim como, a avaliação da IGA foi realizada utilizando a inferência Bayesiana, com uso dos programas da família F90. As herdabilidades estimadas foram: 0,465 ± 0,021, 0,500 ± 0,022, 0,492 ± 0,026, 0,117 ± 0,017 para PE365, PE450, PE550 e IPP respectivamente. Os resultados obtidos nas análises da interação, indicaram que essa não foi significativa para o PE nas diferentes idades (correlação genética, rg >0,8). Para a IPP foi evidenciado efeito significativo da IGA para as combinações envolvendo a região Norte (rg < 0,8), indicando que essa interação deve ser considerada pelos programas de avaliação genética nesta região. Capítulo 2: A eficiência reprodutiva dos rebanhos é um dos fatores de maior importância para a bovinocultura de corte, porém, a diversidade ambiental torna-se um entrave na identificação dos animais geneticamente superiores para essas características, dificultando o progresso genético dos rebanhos no que tange ao sucesso reprodutivo. Diante de tal limitação, o presente estudo visa identificar regiões do estado da Bahia que possuam similaridade ambiental, para isso foram utilizados dados de altitude, precipitação anual, temperatura média anual, umidade relativa do ar (UR%) e classificação climática de Koppen de 28 estações climatológicas do INMET distribuídas entre diferentes municípios do estado. Com a aplicação da análise de agrupamento, utilizando o método hierárquico Unweighted Pair Group Method With Arithmetic Mean (UPGMA), foi possível identificar três regiões distintas. Após a definição das regiões, foram realizadas análises tri-característica para a determinação da presença da interação genótipo-ambiente entre as regiões para as características PE365, PE450, PE550 e IPP, utilizando o programa GIBBS2F90. Diante dos resultados alcançados, foi encontrado indícios de interação genótipo-ambiente para todas as características estudadas (rg < 0,8), indicando que grupos gênicos distintos estão atuando sobre as características a depender do ambiente de criação dos animais. Capítulo 3: O objetivo desse estudo foi identificar regiões do cromossomo X que estão associadas com a expressão das características: ocorrência de prenhez precoce (P16) e idade ao primeiro parto (IPP) em novilhas da raça Nelore, via teste de associação genômica ampla (GWAS) utilizando marcadores SNPs. Foram utilizadas informações fenotípicas de 76.845 e 76.700 para P16 e IPP, as informações genotípicas utilizadas foram de 1999 fêmeas. Utilizou-se a metodologia single step (WssGBLUP), sendo selecionadas as cinco janelas, com 150 SNPs adjacentes, que explicaram a maior proporção da variância genética, bem como, foi verificado o desequilíbrio de ligação (LD) dos maiores cromossomos da espécie Bos taurus indicus, ou seja, cromossomos 1, 2 e X. Os resultados encontrados indicaram que há indícios de efeito dos genes KLHL4, FGF13 e PCDH11X sobre a característica P16, e dos genes KLHL4, FGF13 e TENM1 sobre a IPP. Indicando efeito pleiotrópicos dos genes KLHL4 e FGF13, sendo, portanto, responsáveis também pela correlação genética existente entre as características. Enquanto para o LD, foi verificado que o maior valor encontra-se no cromossomo X, 0,2248±0,17, quando comparado com os outros avaliados, 0,1965±0,14 e 0,1967±0,14, para os cromossomos 1 e 2 respectivamente.

coorelação genética;Bos indicus;herdabilidade;bovinos de corte
Chapter 1: The objective of this study was to evaluate the effect of the genotype-environment interaction (GEI) for scrotal circumference traits measured at different ages, 365 (SC365), 450 (SC450) and 550 (SC550) days of age, and age at first calving (AFC) for Nellore animals raised in different regions of Brazil. For the evaluation, the herds were grouped in the following regions of the country: North, Southeast and Midwest, using information from 26619, 28730, 14476, 15397 for the traits SC365, SC450, SC550 and AFC respectively. Genetic parameters, as well as the assessment of GEI were performed using Bayesian inference, using the programs of the F90 family. The estimated heritabilities were: 0.465 ± 0.021, 0.500 ± 0.022, 0.492 ± 0.026, 0.117 ± 0.017 for SC365, SC450, SC550 and AFC respectively. The results obtained in the analysis of the interaction, indicated that this was not significant for SC at different ages (genetic correlation, rg> 0.8). For AFC, significant effect of GEI was observed for combinations involving the Northern region (rg <0.8), indicating that this interaction should be considered by the genetic evaluation programs in this region. Chapter 2: The reproductive efficiency of herds is one of the most important factors for beef cattle breeding, however, environmental diversity becomes an obstacle in the identification of the genetically superior animals for these traits, hindering the genetic progress of the herds in terms of reproductive success. Because this limitation, the present study aims to identify regions of the state of Bahia that possess environmental similarity, for which altitude, annual precipitation, annual mean temperature, relative humidity (RH%) and Koppen climate classification of 28 INMET climatological stations distributed among different cities of the state. With the application of the cluster analysis, using the hierarchical method Unweighted Pair Method With Arithmetic Mean (UPGMA), it was possible to identify three distinct regions. After the definition of the regions, tri-trait analyzes were performed to determine the presence of the genotype- environment interaction between the regions for the traits SC365, SC450, SC550 and AFC, using the program GIBBS2F90. In the results obtained, evidence of genotype- environment interaction was found for all traits studied (rg <0.8), indicating that distinct genic groups are acting on the traits depending on the environment of animal rearing. Chapter 3: The objective of this study was to identify regions of the X chromosome that are associated with the expression of traits: early pregnancy (P16) and age at first calving (AFC) in Nellore heifers, using genome-wide association study (GWAS) using SNP markers. Phenotypic information of 76,845 and 76,700 were used for P16 and AFC, the genotypic information used was from 1999 females. The single-step method (WssGBLUP) was used, and five windows of 150 adjacent SNPs were selected, which explained the highest proportion of the genetic variance, as well as the linkage disequilibrium (LD) of the largest chromosomes of Bos Taurus indicus. The results indicate that there are indications of the effect of the KLHL4, FGF13 and PCDH11X genes on the P16 trait, and the KLHL4, FGF13 and TENM1 genes on AFC. It also indicates pleiotropic effects of the KLHL4 and FGF13 genes, being therefore also responsible for the genetic correlation between the traits. Regarding the LD, the highest value was found on the X chromosome, 0.2248 ± 0.17, when compared with the other, 0.1965 ± 0.14 and 0.1967 ± 0.14, for chromosomes 1 and 2 respectively.
genetic correlation;Bos indicus;heritability;beef cattle
0
PORTUGUES
UNIVERSIDADE FEDERAL DA BAHIA
O trabalho não possui divulgação autorizada

Contexto

PRODUÇÃO ANIMAL
MELHORAMENTO ANIMAL
Aplicação de ferramentas genômicas no melhoramento genético da eficiência reprodutiva em bovinos da raça Nelore

Banca Examinadora

RAPHAEL BERMAL COSTA
DOCENTE - PERMANENTE
Sim
Nome Categoria
THEREZA CRISTINA BORIO DOS SANTOS CALMON DE BITTENCOURT
HENRIQUE NUNES DE OLIVEIRA Participante Externo
LUIS FERNANDO BATISTA PINTO Docente - PERMANENTE
LUCIA GALVAO DE ALBUQUERQUE Participante Externo

Vínculo

Servidor Público
Instituição de Ensino e Pesquisa
Ensino e Pesquisa
Sim