Os búfalos tem potencial econômico e industrial que está, no entanto, sub-utilizado
devido, entre outros fatores, a baixa eficiência de biotecnologias reprodutivas como a
Produção In Vitro de Embriões (PIVE). A eficiência da PIVE, por sua vez, relaciona-se ao
conhecimento sobre o funcionamento de oócitos e embriões. Nesse sentido, o uso de
Sequenciamento De Nova Geração (NGS) de RNA (RNA-seq) têm proporcionado
avanços para o entendimento dos mecanismos de maturação oocitária e desenvolvimento
embrionário em diversas espécies domésticas, e foram revisados no capítulo 1. Este
trabalho é dedicado ao estudo dos aspectos moleculares da maturação oocitária e
desenvolvimento embrionário em bubalinos. No capítulo 2, foi feita a descrição e análise
dos transcriptomas de oócitos maturados e blastocistos produzidos in vitro de búfalos.
Para isso, mRNA foi extraído para a construção de bibliotecas barcoded, que foram
sequenciadas na plataforma Ion ProtonTM. As reads foram alinhadas ao genoma de
referência bovino (Bos taurus UMD3.1), sendo utilizados o programa Cufflinks para
calcular a abundância relativa dos transcritos e o pacote DESeq2 para analisar a
expressão. Observou-se a expressão de 13.976 genes, dos quais houve genes
compartilhados (62%) e exclusivos com funções especializadas em oócitos (1,6%) e
blastocistos (15,7%). Houve 4.153 genes diferencialmente expressos em blastocistos em
relação aos oócitos, dos quais alguns genes com maior variação de expressão foram
relacionados ao metabolismo de lipídios, implantação e maturação oocitária. Foi
elaborado um painel transcriptômico de oócitos e blastocistos in vitro de búfalos, sendo
discutida a importância de genes alvo promissores em futuras estratégias de
aprimoramento da PIVE na espécie bubalina. No capítulo 3, os transcriptomas de oócitos
e blastocistos de búfalos foram comparados aos de bovinos relatados na literatura. Dado
que os protocolos de PIVE em búfalos são em grande parte inspirados em bovinos, esta
comparação foi utilizada para indicar as simailaridades dos transcriptomas dessas
espécies. Foi utilizada a análise de redes de co-expressão e preservação de módulos do
pacote WGCNA do programa R. Como resultado, foi observada grande similaridade dos
perfis transcriptômicos de búfalos e bovinos. Dos 7 módulos de co-expressão
identificados em búfalos, 4 foram fortemente preservados (Z-summary>10) em bovinos,
sendo suas ontologias gênicas relacionadas ao programa de desenvolvimento
embrionário. Porém, o perfil de expressão dentro dos módulos, definido pelos hub
genes, foi diferente, indicando diferenças importantes, em termos de interações
gênicas, entre as duas espécies. Conclui-se que esta análise inicial dos
transcriptomas de oócitos e blastocistos bubalinos indicou a presença de genes
relevantes para a qualidade oocitária e embrionária. E a comparação dos
transcriptomas de búfalos e bovinos indicoudiferenças de expressão dentro de
módulos conservados que justificam a elaboração de protocolos de PIVE específicos
para búfalos.