O avanço da tecnologia ao longo dos últimos anos instigou a criação de diversos empreendimentos ao redor do mundo, incentivando o surgimento de incubadoras tecnológicas que passaram a disponibilizar espaço, infraestrutura, canais de comunicação e apoio organizacional a empreendedores que desejam estruturar e alavancar seus negócios. Apesar do apoio recebido, muitos gestores não possuem total controle sobre todos os ativos relacionados aos seus negócios, principalmente sobre aqueles que são considerados intangíveis. Tais insciências podem originar riscos, que se não geridos corretamente são capazes de ocasionar problemas graves e crônicos ao longo das diversas etapas do ciclo de vida dos negócios, ou até mesmo causar o fim de uma empresa. Por isso, é fundamental o estabelecimento de metodologias de gestão de riscos organizacionais que estejam aliadas à estratégia de cada negócio. Assim, o objetivo dessa Dissertação é propor uma modelagem que inclui conceitos de Key Performance Indicators, Analytic Hierarchy Process e diagnóstico organizacional, e que possibilite aos gestores de empresas de base tecnológica incubadas ter o controle dos riscos organizacionais decorrentes de ativos intangíveis. A modelagem desenvolvida foi aplicada em 32 empresas distribuídas em sete incubadoras do Rio Grande do Sul, todas anexas a universidades. Os resultados apontam para os principais riscos organizacionais de maneira geral, por capital e por grupo de ativos intangíveis. A Dissertação apresenta a aplicação da modelagem nas empresas, simulando posteriormente ações possíveis para buscar minimizar o impacto gerado por cada um dos riscos organizacionais identificados. Foram compilados os dados de todas as empresas participantes do estudo e analisados os riscos mais recorrentes e seus impactos prováveis em todo o universo de empresas, por capital e por incubadora.