O objetivo desse estudo foi avaliar os efeitos do prebiótico Frutooligossacarídeo (FOS) no desempenho dos potros lactentes bem como no pH fecal e nas características físicas e químicas das fezes desses animais. O experimento foi realizado no Haras do Cabral em Rio Claro, RJ. Foram utilizados 16 potros Mangalarga Marchador em delineamento experimental inteiramente casualizado, em esquemas de parcelas subdivididas, com dois tratamentos e oito repetições (animais). Tratamento I - fornecimento uma vez ao dia, via oral, do aditivo FOS e o Tratamento II (controle) – os animais recebiam solução aquosa, via oral, sem o aditivo FOS. O período experimental foi de 75 dias, iniciando a suplementação ao nascimento. Amostras diárias de fezes foram coletadas diretamente do reto do nascimento até o 30o dia de idade. Do 30o dia em diante, as coletas ocorreram a cada 4 dias, até os 75o dia de idade. Imediatamente após a coleta anotou-se em uma ficha de coleta a consistência e coloração das amostras. O pH foi avaliado a partir das amostras previamente diluídas em iguais quantidades de água destilada através de um potenciômetro digital. Para análises químicas as amostras foram homogeneizadas em amostras compostas semanais e realizadas análises bromatológicas. O desempenho dos potros foi avaliado através do peso vivo e por meio de medidas morfométricas lineares e de perímetros. Os resultados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste Student Newman Keuls, adotando-se 5% de probabilidade, através do programa SAEG- UFV. Os valores da caracterização fecal foram comparados pelo teste de Wilcoxon na análise entre os tratamentos e, comparados pelo teste de Kruskal-Wallis na análise entre os tempos de coleta, sendo utilizado o programa Bioestat® 5.3. Não foram observados efeitos significativos (p<0,05) na suplementação e interação idade versus suplementação para todas as variáveis analisadas. O ganho de peso médio diário foi de 0,63 kg durante o período experimental. As variáveis morfométricas apresentaram crescimento médios de 17,8, 18,7, e 27,5 cm para altura da cernelha, altura da garupa, comprimento do corpo e perímetro torácico, respectivamente, do nascimento aos 75 dias de idade. Percentuais de crescimento médio de 31,1, 53,8, 15,6, 22,4, 12 e 12,3% foram observados para altura e largura do costado, altura do vazio subesternal, perímetros do antebraço, joelho e canela, respectivamente. O uso do prebiótico frutooligossacarídeo não influenciou no pH fecal, apresentando valores médios de 7,22. Não houve diferença significativa (P<0,05) nas características físicas e químicas das fezes. O uso do prebiótico frutooligossacarídeo não influencia no desempenho de potros lactentes do nascimento aos 75 dias de idade. Maiores investigações devem ser realizadas para avaliar as respostas obtidas através de parâmetros fecais e sua relação como indicador da saúde gastrointestinal. A dose utilizada de frutooligossacarídeo não promove diarréias e distúrbios gastrointestinais em potros lactentes.