Objetivou-se neste estudo, avaliar os aspectos moleculares de conceptos de porcas gestantes da raça local Piau e linhagem Comercial, além de sua relação com o aproveitamento e perdas durante o período pré-natal. Os genes alvos foram: HHIP, SHH, IHH (desenvolvimento via hedgehog), WNT1, WNT4 (desenvolvimento), FGF4, SOX2 (alongamento), BAX, BCL2 (apoptose). Foram utilizadas 30 marrãs (15 de raça Piau e 15 de linhagem Comercial). Foi utilizado um delineamento inteiramente casualisado em esquema fatorial 2x5 (2 grupos genéticos x 5 idades) com três repetições, sendo 15, 30, 45, 60 e 90 dias, as idades gestacionais estudadas. A expressão gênica foi avaliada mediante a técnica de RT-PCR quantitativa. As análises estatísticas de expressão gênica foram realizadas no software SAS® 9.3 por meio da macro QPCR_MIXED. Os genes relacionados ao desenvolvimento dos conceptos suíno via hedgehog, HHIP, SHH e IHH, são mais expressos no terço médio e final da gestação em marrãs da raça Piau e de linhagem comercial. Além disso, há interação genótipo e idade gestacional na expressão desses genes. Relacionados também ao desenvolvimento, porém, pela via WNT, os genes WNT1 e WNT4 são expressos mais precocemente e com maiores valores no primeiro terço gestacional, principalmente em marrãs da raça Piau. Do mesmo modo, a expressão dos genes FGF4 e SOX2, envolvidos no alongamento dos conceptos, ocorre mais precocemente em marrãs da raça Piau. A expressão dos genes pré e pós-apoptótico, BAX e BCL2, respectivamente, apresentam variação entre as fases gestacionais, havendo maior expressão na fase inicial da gestação. Contudo não há interação da expressão desses genes com o genótipo dos animais. Em geral, o estudo das interações genótipo e idade gestacional auxiliam no entendimento dos eventos fisiológicos que ocorrem durante o desenvolvimento dos conceptos suíno.