O objetivo desse trabalho foi avaliar a conformação física e a bioquímica sérica de equinos atletas da raça Brasileiro de Hipismo em treinamento para a modalidade de Concurso Completo de Equitação, assim como, identificar polimorfismos nos genes ACTN3 e MSTN, envolvidos com o desempenho esportivo, com a finalidade de detectar possíveis parâmetros que possam estar relacionados ao rendimento nas competições. Inicialmente, foram selecionados 139 equinos atletas (Equus caballus) da raça Brasileiro de Hipismo, machos e fêmeas, em treinamento e competição para diferentes modalidades hípicas com idades entre 4 e 22 anos para análises bioquímicas de creatina quinase (CK), aspartato aminotransferase (AST), ureia, creatinina, gama-glutamiltransferase (GGT), cálcio e albumina. Desse grupo, foram escolhidos, de forma randomizada, 17 cavalos atletas da raça Brasileiro de Hipismo para avaliação da capa de gordura e do desempenho em esteira de alta velocidade; avaliação das medidas morfométricas físicas e índices zootécnicos; e análise de variantes gênicas em ACTN3 (éxon 15) e MSTN (íntron 1-2) por meio do sequenciamento direto de DNA. Os resultados da avaliação morfométrica e dos índices zootécnicos mostraram-se dentro do esperado para o tipo de atividade realizada por esses cavalos, caracterizando equinos atletas com potentes membros posteriores adaptados para o esforço exigido pelo Concurso Completo de Equitação. As médias dos resultados da avaliação bioquímica dos constituintes séricos AST, CK, uréia, creatinina, GGT, cálcio e albumina apresentaram-se dentro dos valores estipulados pela literatura de referência. As análises dos eletroferogramas resultantes dos sequenciamento de DNA revelaram duas variantes novas no íntron 14-15 do gene ACTN3 equino. Uma correlação significativa (p=0,017) foi encontrada entre uma destas variantes e a espessura da capa de gordura. Nove variantes foram identificadas durante as análises das sequências de nucleotídeos do íntron 1-2 do gene MSTN equino, dentre estas, uma nova variante, ainda não descrita na literatura. Com base nos resultados encontrados, equinos atletas da raça Brasileiro de Hipismo em treinamento da modalidade Concurso Completo de Equitação parecem apresentar metabolismo e conformação física adaptada ao desempenho esportivo. A busca ainda inicial de informações a respeito dos marcadores genéticos de desempenho atlético e suas correlações diretas com os resultados dos cavalos nas competições, os dados desencontrados a respeito dessas correlações e a herança poligênica dessas características demonstram o longo caminho a ser percorrido para alcançar possíveis explicações. Portanto, a proposta principal deste estudo foi constituir um conjunto de dados que possam servir como base para o maior conhecimento desta genuína raça brasileira que apresenta reconhecido e indiscutível valor em competições nacionais e internacionais.