Brasi

Dados do Trabalho de Conclusão
UNIVERSIDADE FEDERAL DO ABC
NANOCIÊNCIAS E MATERIAIS AVANÇADOS (33144010006P9)

Estabilidade Estrutural e Energética de Nanotubos de Difenilalanina
YGOR MORAIS JAQUES
DISSERTAÇÃO
02/08/2013

Nesta dissertação, apresentamos um estudo por dinâmica molecular clássica de nanoestruturas constituídas de nanotubos de difenilalanina. Esses nanotubos são formados pela auto-organização de peptídeos, que geram posteriormente estruturas maiores, os microtubos. A estrutura em particular da difenilalanina ganhou muita atenção por essa sequência ser responsável pela formação das fibras amilóides e uma de suas aplicações mais importantes ser o seu uso como moldes para a produção de nanofios metálicos. Muitas questões relacionadas ao processo de auto-organização dessas moléculas estão ainda sendo investigados. Além disso, a estabilidade e a funcionalização das estruturas já formadas são outras questões a serem consideradas. Dessa forma, neste trabalho faremos simulações que visam investigar a estabilidade dos nanotubos de difenilalanina. Consideramos primeiramente três estruturas representativas, a rede cristalina, um feixe de nanotubos e um único nanotubo. Após essa análise, partimos para simulações onde investigamos a interação de moléculas cromóforas com a superfície dos nanotubos, visando estudar o processo de funcionalização destas. Nossos resultados de dinâmica clássica e perfis de energia livre mostraram que as estruturas formadas pelos nanotubos são estáveis e além disso puderam ser funcionalizadas, aumentando o número de possíveis aplicações.

dinâmica molecular clássica, nanotubos de difenilalanina, umbrella sampling
In this dissertation, we present a classical molecular dynamics study of nanostructures constituted of diphenylalanine nanotubes. These nanotubes are formed by self-assembly of peptides, which subsequentely generate larger structures, the microtubes. This structure gained much attention for being the responsible sequence for the amyloid fibrils formation and one of its most important applications was in its use as templates to the production of metallic nanowires. Many issues related to the self-assembly process of these molecules are still being investigated. In addition, the stability of the structures already formed is another issue to be considered. Thus, in this work we performed simulations aiming to investigate the stability of the diphenylalanine nanotubes. First, we considered three representative configurations, the crystal lattice, a bundle of nanotubes and a unique nanotube. Following this analysis, we performed simulations to investigate the interaction between chromophore molecules with the nanotube surface to get insigths of its functionalization. Our results of classical dynamics and free energy profiles showed that the structures formed by the nanotubes are stable and could be functionalized, incresing the number of possible applications.
classical molecular dynamics, diphenylalanine nanotubes, umbrella sampling.
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PORTUGUES
UFABC

Contexto
NANOCIÊNCIAS E MATERIAIS AVANÇADOS
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Banca Examinadora
Orientador:
EUDES ETERNO FILETI
O orientador principal compôs a banca do discente?
Sim
Nome Categoria
CAETANO RODRIGUES MIRANDA Docente
DOUGLAS SOARES GALVAO Participante Externo

Financiadores
Financiador - Programa Fomento Número de Meses
FUNDACAO DE AMPARO A PESQUISA DO ESTADO DE SAO PAULO - Bolsa de Mestrado 23
CONS NAC DE DESENVOLVIMENTO CIENTIFICO E TECNOLOGICO - Bolsa de Mestrado no País GM 6

Vínculo
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Não
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