Diabetes mellitus tipo 2 e síndrome metabólica são duas doenças metabólicas relacionadas ao distúrbio do metabolismo dos carboidratos e lipídeos. Os receptores PPAR (receptores ativados por ativadores de peroxissomas) são uma família de receptores nucleares responsáveis pela transcrição de genes que regulam o metabolismo energético e outras funções celulares, como diferenciação de tecido adiposo, dentre outras. Entretanto, substâncias que ativam os receptores PPAR estão relacionadas ao tratamento de doenças metabólicas. Neste trabalho foram construídos modelos de QSAR 2D e 3D para fornecer indícios físico-químicos sobre os fragmentos/grupos moleculares importantes para a ativação do receptor PPARδ, assim como informações sobre os campos de interação moleculares de natureza eletrostáticas, estereoquímicas e hidrofóbicas. Os modelos de HQSAR, CoMFA e CoMSIA construídos apresentaram significativos valores de validação interna (0,660, 0,821 e 0,712, respectivamente) e externa (0,732, 0,802 e 0,791, respectivamente). Também foi empregado um protocolo de triagem virtual baseado na estrutura do receptor utilizando o método de acoplamento molecular para identificar novos ligantes de PPARδ. Dos 5 ligantes identificados pela técnica de triagem virtual, 4 apresentaram atividade biológica sobre os receptores PPAR, indicando que o protocolo empregado foi apropriado para o problema em questão. O valor de atividade biológica do composto pan-agonista mais ativo foi de 134,2, 324 e 18,11 µM para PPARδ, α e ƴ, respectivamente, e o composto PPARƴ agonista apresentou um valor de EC50 igual a 190,8 µM.