A algaroba, Prosopis juliflora (Sw) DC, é considerada uma alternativa na alimentação
de animais em regiões semiáridas, apresentando importância econômica e social. A
referida espécie tem recebido atenção por pesquisadores em estudos genéticos
moleculares, embora, pouco se sabe sobre a sua diversidade e estrutura genética. Assim,
objetivou-se gerar informações relativas à extração de ácidos nucleicos, uso de
marcadores moleculares e estimativas de diversidade e estrutura genética que
contribuam para subsidiar ações de manejo e melhoramento genético em P. juliflora
(Sw.) DC. Para isto, foram testados sete protocolos de extração de DNA genômico
disponíveis na literatura, utilizados em diferentes espécies vegetais. Os protocolos
foram otimizados por meio da eliminação do uso de β-mercaptoetanol, nitrogênio
líquido, proteinase K e RNAses. Após as etapas de extração, foi analisada a qualidade e
quantidade de DNA obtido e, por fim, realizado teste de amplificação com uso de
marcador molecular Resistance Gene Analogs - RGA. Ao final, selecionou-se os três
protocolos mais eficientes para a obtenção do DNA genômico: tampão SDS 10%,
CTAB 5% e Sorbitol; sendo utilizado o SDS 10% para extração do DNA nos próximos
estudos. Posteriormente, foram caracterizados e selecionados 17 combinações de
marcadores moleculares RGA, em 20 amostras de DNA genômico da planta extraídas
de espécimes coletadas no município de Itapetinga, Bahia. Com base nos perfis de
amplificação os pares de iniciadores foram classificados como: Adequado; Razoável e
Inadequado. Também foram realizadas análises descritivas associadas ao número de
marcadores gerados, onde os percentuais de polimorfismo variou entre 60% e 100%, a
média da Heterozigosidade Esperada (He) foi de 0,21 e, o conteúdo de informações
polimórficas (PIC) médio foi de 0,17. Dos 17 pares de iniciadores analisados, 10 foram
selecionados para estimar a diversidade e a estrutura genética de população referente à
sete populações naturalizadas da mesorregião centro sul baiano, composta por 48
acessos e 144 acessos da coleção de germoplasma do Instituto Federal Baiano foram
incluídas nas análises. Com base nos perfis de amplificação, realizou-se a genotipagem
e a construção da tabela de dados binários. As análises descritivas, Análise de Variância
Molecular (AMOVA) e Análise de Coordenadas Principais (PCoA) também foram
realizadas. Observamos um total de 147 marcas, cuja média de polimorfismo foi de
51,7% , sendo 12 marcas raras e cinco exclusivas. A Heterozigosidade esperada
apresentou média de 0,17, variando de 0,05 em Anagé e 0,32 em Caculé. O conteúdo
de informação de polimorfismo variou de 0,04 a 0,25 com média de 0,14. Os acessos
estudados apresentaram estruturação em dois pools gênicos e subestruturação em três
pools gênicos. A partir dos atributos genéticos moleculares apresentados nesse estudo, a
presente Tese busca subsidiar futuros planos de manejo das populações de Prosopis
juliflora naturalizada na mesorregião sudoeste da Bahia.