As hemoparasitoses caninas são um conjunto de doenças causadas por microrganismos intracelulares, como bactérias e protozoários, transmitidos principalmente por carrapatos. Seu diagnóstico geralmente é realizado com base na observação de alterações hematológicas sugestivas como anemia, trombocitopenia e leucopenia, podendo ou não serem observadas formas sugestivas no exame direto, contudo a realização de exames com maior sensibilidade vem sendo recomendada, como a PCR. Apesar da ampla distribuição, existem poucos relatos acerca da prevalência na região Norte, mais especificamente na Amazônia Ocidental. Dessa forma, o presente estudo objetivou avaliar a prevalência de Ehrlichia spp., Babesia spp. e Anaplasma spp. em cães trombocitopênicos ou com inclusões sugestivas de hemoparasitos no Município de Rio Branco, Acre. Para isso foram coletadas amostras de sangue total de 70 cães com inclusões sugestivas de hemoparasitos e/ou quadros trombocitopênicos e submetidos à análise hematológica, ao teste SNAP 4DX e à Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) para piroplasmas, com alvo o gene 18s RNA, e para agentes da família Anaplasmataceae para o gene 16s RNA. Os dados foram tabulados e submetidos à análise estatística e o coeficiente Kappa foi utilizado para avaliar a concordância entre os testes. Já para verificar a normalidade dos dados, foi feito o Shapiro-Wilk, seguido pela ANOVA e teste T quando dados de distribuição normal, enquanto que para os não paramétricos fez-se o teste de Wilcoxon. Avaliou-se associação entre as variáveis através do X . A avaliação sorológica foi considerada reagente em 91,43% (64/70) dos pacientes, enquanto que a PCR resultou em 67,14% (47/70) de positividade, considerando um ou mais agentes. A infecção por Ehrlichia canis correspondeu ao maior número de casos com 61,43% (43/70) do total, seguido de 14,28% (10/70) para Babesia canis vogeli e 2,85% (2/70) para Anaplasma platys. Foram confirmados oito casos de coinfecção por E. canis e B. vogeli. Não houve influência da ocorrência de trombocitopenia ou do sexo dos animais. Verificou-se maior propensão à infecção por hemoparasitos em cães de um a cinco anos, enquanto os cães com menor predisposição possuíam acima de cinco anos de idade. Com os resultados obtidos no presente estudo foi possível concluir que a infecção por E. canis foi mais prevalente na população avaliada e que a associação entre os métodos diagnósticos é imprescindível para confirmação dos casos.