A Síndrome dos ovários policísticos (SOP) reduz a taxa de ovulação além aumentar o risco de complicações durante a gestação, como o desenvolvimento de diabetes gestacional, hipertensão, de pré-eclampsia, nascimentos prematuros e abortos. Assim, objetivou-se avaliar os efeitos da melatonina associada a um tratamento pré-existente, a metformina, como uma alternativa terapêutica para o tratamento da SOP administradas antes e durante o período gestacional, e seus efeitos sobre a prole. Para isso foram utiizadas 40 ratas divididas em 5 grupos: Grupo I- Sem indução da SOP; II- Induzidos à SOP; III- Induzidos à SOP e tratados com Metformina; IV- Induzidos à SOP e tratados com Melatonina e V- Induzidos a SOP e tratados com Metformina e Melatonina. A indução foi realizada mediante gavagem de Letrozol na dosagem de 1mg/kg/dia durante 21 dias consecutivos. A metformina foi administrado 10 dias antes e durante todo o período gestacional na dosagem de 50 mg/100g, também por gavagem, assim como a melatonina, na dose de 0,5mg/kg, por via oral, diluída na água de beber. Foram realizadas análises hormonais, bioquímicas, imunohistoquímicas, mofológicas e morfométricas, além do acompanhamento do ganho de peso dos animais e o índice organossomático tanto da matrizes, quanto dos neonatos. Foi possível observar que a melatonina exógena foi mais eficiente em reverter os parâmetros decorrentes da indução da SOP nas matrizes, como a aciclicidade estral, aumento do peso corporal, alterações metabólicas (elevação nos níveis de colesterol total, triglicerídeos, e LDL) ovarianas (cistos ovarianos) e hormonais, do que sua associação com a metformina. Essa por sua vez, também apresentou efeitos benéficos em ralação a alguns parâmetros decorrentes da policistose, entretanto, sua utilização durante a gestação promoveu algumas alterações nos filhotes, como diminuição do peso dos ovários, vacuolização e degeneração dos túbulos seminíferos, alterações nos níveis de estrógeno e testosterona e na expressão dos receptores androgênicos testiculares. Já os filhotes das matrizes que receberam melatonina durante a gestação, apresentaram os parâmetros analisados semelhantes aos filhotes do grupo controle. Assim, a utilização da melatonina mostrou-se mais eficaz do que a associação dos fármacos uma vez que as alterações decorrentes da SOP e da utilização da metformina durante a gestação puderam ser normalizadas com a sua utilização no período gestacional, não apresentando efeitos adversos sobre a prole.