Trypanosoma cruzi é um protozoário que parasita humanos e é o agente causador da doença de Chagas. Atualmente a espécie é dividida em seis grupos taxonômicos, altamente polimórficos. O clone CL Brener teve seu genoma estimado entre 106,4-110,7Mb e análises de conteúdo de DNA revelaram que se trata de um clone diploide. Trypanosoma rangeli é um hemoflagelado que possui os mesmos reservatórios e vetores que o T. cruzi, mas se diferem pelo fato de que ele não é patogênico para hospedeiros vertebrados e sim para o vetor invertebrado. O genoma de T. rangeli foi previamente estimado em 24Mb e as cepas do parasito podem ser divididas em KP1(+) e KP1(-), de acordo com a ausência ou presença de minicírculos no kDNA. O sequenciamento prévio de dois loci de T. rangeli sugeriu que algumas de suas cepas podem ser heterozigotas. Assim, o objetivo desse trabalho foi investigar o conteúdo de DNA em diferentes cepas de ambos os parasitos. Foram utilizadas as cepas KP1(+) P02, P07, P18, P19, P21, Cas 4 e KP1(-) SO28 e SO29 de T. rangeli e as cepas CL Brener, Alv, JG, e RN1 de T. cruzi. As cepas foram cultivadas em meio LIT a 28º C e posteriormente fixadas em etanol 70% e marcadas com iodeto de propídio para análise por citometria de fluxo. O conteúdo de DNA das cepas de T. cruzi foi estimado em 69,0Mb, 90,4Mb e 106,4Mb para as cepas Alv, RN1, e JG, respectivamente. Na linhagem KP1(+) de T. rangeli o conteúdo de DNA foi estimado em 117,7Mb, 75,4Mb, 119,7Mb, 71,5Mb, 112,5Mb e 71,0Mb para as cepas P02, P07, P18, P19, P21 e Cas4, respectivamente. Na linhagem KP1(-) o conteúdo de DNA das cepas SO28 e SO29 foi de 111,9Mb e 66,2Mb, respectivamente. A partir desses resultados podemos concluir que o conteúdo de DNA de T. cruzi variou entre 69,0-106,4Mb e nas cepas de T. rangeli variou entre 66,2-119,7Mb. As diferenças no conteúdo de DNA das cepas de T. rangeli não foram associadas aos genótipos/linhagem do parasito, sendo que as cepas KP1(+) apresentaram conteúdos de DNA de 71,0Mb a 119,7Mb e cepas KP19(-) apresentaram conteúdos de DNA de 66,2Mb e 111,9Mb. A partir da comparação com dados de sequenciamento de dois loci, as cepas P07 e Cas4 parecem corresponder a híbridos diploides de T. rangeli enquanto as cepas P02, P18, P21 (linhagem KP1(+)) e cepa SO28 (linhagem KP1(-)) parecem ser organismos tetraploides de acordo com o conteúdo de DNA estimado.