A criação de pecaris (queixada, Tayassu pecari e cateto, Pecari tajacu) em cativeiro é apontada como uma alternativa à caça e ao desmatamento em países neotropicais. Ambas as espécies, no entanto, preocupam no que diz respeito ao seu bem-estar durante o manejo para contenção. Dessa forma, comparamos a resposta comportamental e o temperamento de 17 queixadas e 19 caititus durante a contenção no tronco para avaliar os procedimentos de manejo. Foi comparado o tempo (s) necessário para conduzir os animais no brete e logo em seguida sua velocidade de saída utilizando o Mann-Whitney U-test. Avaliou-se também o temperamento de cada animal contido no tronco por 20s, usando quatro avaliadores com 70% de concordância através da QBA a partir do teste de ACP. Não houve diferença no tempo gasto para condução de ambas as espécies ao tronco (caititus: 26,1±7,33s; queixadas: 44,9±19,1s; U=121,0; df=17; P=0,2). Os queixadas, no entanto, foram mais rápidos estatisticamente do que os caititus na velocidade de saída (queixadas: 2,3±0,5m/s; caititus:1,5±0,5m/s; U=85,5; df=17; P=0,04). Os valores negativos do componente 1, que explicou 80,73% da variância dos dados de temperamento, foram associados com os seguintes comportamentos assertivos: relaxado, calmo, entediado, apático, satisfeito e dócil, e seus valores positivos foram relacionados com os seguintes comportamentos negativos: agressivo, ativo, medroso, agitado, tenso, alerta, nervoso, ansioso e estressado. Todos, com exceção de quatro queixadas, foram associados com estes comportamentos negativos, enquanto que 12 dos 19 caititus foram associados com os comportamentos assertivos. Aparentemente, os caititus mostraram um comportamento com maior predisposição a serem amançados e criados em cativeiro. A reatividade dos queixadas revelou que há necessidade de melhorias nas práticas de manejo para esta espécie, comparando a utilização de diferentes formas de curral-armadilha, por exemplo, para reduzir o estresse destes animais durante sua contenção e consequentemente melhorar seu bem-estar.