As leucemias são um grupo heterogêneo de doenças que se caracterizam pela proliferação clonal de células hematopoéticas, que sofreram alterações genéticas, manifestadas durante sua diferenciação. Na leucemia mielóide aguda, o evento leucemogênico ocorre em uma célula-tronco, comprometida com a linhagem mielóide, impedindo a maturação e a diferenciação das células. As leucemias mielóides agudas são morfologicamente subclassificadas em 8 subtipos, que variam entre M0 e M7 de acordo com o grau de maturação celular. Na leucemia mielóide aguda podem ser encontradas alterações citogenéticas associadas com os subtipos da classificação FAB, como por exemplo, a t(8;21)(q22;q22) associada ao subtipo M2, a t(15;17)(q22;q21) ao M3, e a inv(16)(p13;q22) ao M4, as quais estão associadas a um prognóstico favorável. Por outro lado, pacientes que apresentam -5 ou a del(5q), -7, a del(7q), a inv(3q)/t(3;3)(q21;q26), a t(6;9)(p23;q34), del(9q), t(9;22)(q34;q11), rearranjo do gene MLL e, cariótipos complexos, com estas anormalidades e/ou outras aberrações crípticas, são selecionados para protocolo de alto risco, incluindo o transplante de medula óssea. A citogenética é uma importante ferramenta de estudo na leucemia mielóide aguda, e embora algumas aberrações já sejam classificadas, ainda, 10-12% dos pacientes com leucemia mielóide aguda, apresentam cariótipos com três ou mais aberrações, muitas vezes crípticas. Uma vez que tem sido sugerida uma possível correlação entre a combinação das aberrações detectadas, em um cariótipo complexo, e a resposta clínica, fica clara a necessidade de um refinamento na caracterização deste tipo de perfil cariotípico. Neste contexto, o presente estudo pôde refinar a caracterização de cariótipos complexos, bem como suas anormalidades crípticas, a partir de amostras de pacientes pediátricos diagnosticados com leucemia mielóide aguda, através da aplicação técnicas de citogenética molecular, fluorecense in situ hibridization, Multiplex-FISH e o multicolor chromosome banding. Este trabalho pôde contribuir com a literatura, descrevendo duas novas anormalidades cromossômicas crípticas, presentes em cariótipos complexos, onde uma teve importância na citogenética inicial e a outra apresentou impacto na evolução clínica e estratificação de risco do paciente. Deste modo, nosso trabalho mostrou a importância da combinação das três técnicas de citogenética molecular, em refinar os cariótipos complexos dos pacientes pediátricos com leucemia mielóide aguda, na tentativa de identificar biomarcadores que sejam potenciais alvos terapêuticos