Objetivo: Avaliar a função endotelial em pacientes com fatores de risco para aterosclerose pela dilatação fluxo-mediada da artéria braquial (DILA) e complexo médio-intimal (CMI) das artérias carótida e braquial. Material e método: Estudo transversal, caso controle, no qual foi avaliada a função endotelial pela DILA e CMI das artérias carótida e braquial e presença ou não de fatores de risco para aterosclerose, em 112 pacientes assim distribuídos: mulheres com fatores de risco (n = 49), mulheres grupo controle (n = 24), homens com fatores de risco (n = 21) e homens grupo controle (n = 18). Resultados: A DILA esteve comprometido significativamente no grupo fator de risco, quando comparado ao controle, independente do sexo: em mulheres, 15,3% vs 25,4% (p = 0,000); em homens, 11,8% vs 16,8% (p = 0,008). Já o CMI, tanto na braquial quanto na carótida, não foi significativo, independente do sexo: braquial em mulheres, 0,3mm vs 0,3mm (p = 0,983); braquial em homens, 0,36mm vs 0,23mm (p = 0,069); carótida em mulheres, 0,6mm vs 0,4mm (p = 0,068); carótida em homens, 0,80mm vs 0,38mm (p = 0,078). Utilizou-se como nível de significância p < 0,05. Conclusão: A DILA foi eficiente para atestar comprometimento endotelial em população de risco para aterosclerose.